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DFG project G:(GEPRIS)289535226

Polyploidie in halophilen Archaea: Evolutionäre Vorteile und molekulare Regulationsmechanismen.

CoordinatorProfessor Dr. Jörg Soppa
Grant period2015 - 2020
Funding bodyDeutsche Forschungsgemeinschaft
 DFG
IdentifierG:(GEPRIS)289535226

Note: Halophile Archaea sind polyploidy und ihr Hauptchromosom enthält mehrere Replikationsursprünge. Wir werden die beiden Replikationsursprünge oriC1 und oriC2, die sehr unterschiedliche Eigenschaften aufweisen, von Haloferax volcanii verwenden, um die molekularen Mechanismen der Kopienzahlregulation aufzuklären. Kürzlich wurden Haloarchaeale Artifizielle Chromosomen (HACs) etabliert, die ideale molekulare Werkzeuge darstellen, um verschiedene Elemente zu charakterisieren, die an der Kopienzahlregulation beteiligt sind. Dazu zählen die Kernbereiche der Origins sowie konservierte benachbarte Gene. Die Gene und mutierte Versionen werden in HACs integriert werden, und die Effekte auf die Kopienzahl wird untersucht werden. Außerdem werden Versionen dieser Proteine mit Affinitätstags versehen werden, um Interaktionsnetzwerke an Origins aufzuklären. Kürzlich haben wir isogene Stämme von H. volcanii mit unterschiedlichen Ploidiegraden erzeugt. Diese Stämme werden es erstmals erlauben, evolutionäre Vorteile von Polyploidie zu quantifizieren, indem Mischungen von farbkodierten Zellen kompetitivem Wachstum oder kompetitiven Überlebensversuchen ausgesetzt werden. Die Vorteile vieler Genomkopien für das Überleben unter Stressbedingungen, mutagenen Bedingungen, Langzeitüberleben usw. werden untersucht werden. Außerdem werden die Genomekopienzahlen einiger weiterer haloarchaealer Arten von bislang uncharakterisierten Gattungen quantifiziert werden.
   

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 Record created 2023-02-02, last modified 2024-09-27
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